A létesítmény 1944 februárjától 1945 nyaráig kórházként szolgált, majd Budapest 1945-ös ostroma során a városvédők utolsó működő kórházává vált. A hidegháború idején a kórházat továbbépítették és titkos atombunkerré alakították át. A működőképes gépészettel és korabeli berendezési tárgyakkal, és a több mint 200 viaszfigurával felszerelt létesítményben páratlan múzeumi élménnyel gazdagodhatnak a látogatók.

A múzeum – arculatával és tematikájával összhangban – nagy hangsúlyt fektet arra, hogy megőrizze azt a kivételes szellemiséget és példaértékű hozzáállást, amit a Sziklakórházban dolgozó mindennapi hősök – orvosok, nővérek, önkéntesek – tanúsítottak a 20. század történelmi viszontagságainak idején. 

A múzeum számos gyermek számára biztosít lehetőséget a történelmi érdekességek megtekintésére, segítve ezzel a Baptista Szeretetszolgálat munkáját.